Про передачу файлов с МФ и на МФ тут был большой отдельный топик, рекомендую почитать.
Если в операционной системе поднят FTP-сервер, то проще всего отправлять/принимать файлы с его помощью.
Так работает:
1. Создать последовательный набор (Пример: IBMJZOS.BIN) с RECFM=FB,LRECL=0124,BLKSIZE=27648. Достаточно 20 треков.
2. Зайти в OMVS (tso omvs), скопировать файл в набор
cp /usr/lpp/java/J6.0/lib/ext/ibmjzos.jar "//IBMJZOS.BIN"
3. Принять набор в двоичном режиме через терминал. IBM JDK любой нужной версии можно получить здесь:
Java™ Standard Edition Products on z/OS
Там есть как обновления для SMPE, так и независимые архивы, которые достаточно распаковать в z/OS и использовать.
Есть отдельная страница, на которой можно забрать пакет JZOS, отдельно от JDK.
IBM JZOS Batch Toolkit for z/OS SDKs
Обновлять JDK желательно, как собственно и любой софт, но не обязательно.
Если обновить системный JDK проблематично, то ИМХО проще скачать JDK в архиве, распаковать его в z/OS в подходящий каталог и пользоваться им.